Добрый день!
Цитата: У меня возникло сомнение насколько это корректно, ведь иностранный поставщик не может выставить нам счет-фактуру,в его документах товар будет без НДС, правильно ли я понимаю?
Да, в стоимости товара не должно быть НДС. Ни российского, ни эстонского.
Поэтому, если счет-фактура и будет, то явно не российского образца.
Цитата: Какие документы должны поступить нам от поставщика и на основании чего делаются проводки по оприходованию импортного товара (ГТД или накладной поставщика)?
Эстонская сторона, скорее всего, Вам представит "инвойс". Это своеобразная комбинация счета на оплаты и товарной накладной.
Больше всего подходит название "счет-фактура". Когда-то давно так и переводили, но с введением в России совсем иного документа с таким названием полностью поменяла смысл термина "счет-фактура", поэтому слово "инвойс" сейчас переводят по иному.
По инвойсу определяете стоимость товара без НДС (цена поставщика).
НДС определяете по ГТД.
При этом имейте в виду, что таможенная стоимость, как правило, отличается от цены поставщика. Хотя бы тем, что таможенники добавляют в нее стоимость перевозки. Кроме того, таможня может изменить и цену поставщика, если посчитает ее заниженной.
Поэтому товар приходуете по одной стоимости (по фактической), а НДС по ГТД.
Успехов!